慢性肾功能衰竭的病因以各种原发性及继发性肾小球肾炎占首位,其次为泌尿系统先天畸形(如肾发育不良、先天性多囊肾、膀胱输尿管反流等)、遗传性疾病(如遗传性肾炎、肾髓质囊性病、Fanconi综合征等),全身性系统疾病中以肾小动脉硬化、高血压、结组织病等多见。肾脏病变引起的小球滤过率降低和肾小管功能障碍,导致水、酸碱平衡障碍;毒性物质的潴留;内分泌代谢异常以及免疫功能降低等。
中医学认为,因禀赋素弱,或因劳累过度,或者说因饮食不节,或因复感外邪,或因久治不愈,肾气日衰,脏腑虚损,脾虚则健运无权,水谷不化,血液乏于滋生,湿毒壅塞三焦,清气不升,浊气不降,肾失开阖,气化无权,不能分清别浊,湿浊之邪内蓄体内,毒邪不得外解,怒必内渍,于是邪陷心包,肾虚风动,直至心肾俱败而告终。